La loi du 22 juillet 2013 relative à l'enseignement supérieur a transformé les PRES en Communauté d'universités et établissements "COMUE". En Aquitaine, les établissements fondateurs du PRES ont travaillé ensemble pour créer la Communauté d'universités et établissements d'Aquitaine ou Comue d'Aquitaine ou encore CUEA. Héritière du Pôle de Recherche et d'Enseignement Supérieur de Bordeaux, les statuts de la Communauté ont été adoptés par ses six membres, approuvés par le décret n° 2015-281 du 11 mars 2015 et publiés au journal officiel de la République Française.

La Comue d'Aquitaine a pour mission de :

• piloter la stratégie numérique à l’échelle de la région Aquitaine,
• coordonner l'offre de formation et la stratégie de recherche et de transfert de ses membres à l'échelle de la région Aquitaine,
• organiser la coordination territoriale des établissements d'enseignement supérieur membres et partenaires à l'échelle de la région Aquitaine,
• élaborer avec le réseau des œuvres universitaires et scolaires un projet d'amélioration de la qualité de la vie étudiante et de promotion sociale sur le territoire, en associant l'ensemble des établissements partenaires,
• porter le volet commun du contrat pluriannuel conclu avec la ministre chargée de l’enseignement supérieur sur la base du projet partagé.